MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia japonica YH

Total Repeats: 32796

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016050	ATT	2	6	13	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273054
2	NC_016050	GCA	2	6	58	63	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350273054
3	NC_016050	TAT	2	6	182	187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273054
4	NC_016050	ATT	2	6	274	279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273054
5	NC_016050	T	6	6	293	298	0 %	100 %	0 %	0 %	350273054
6	NC_016050	ATG	2	6	392	397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273054
7	NC_016050	TAATA	2	10	429	438	60 %	40 %	0 %	0 %	350273054
8	NC_016050	GTA	2	6	574	579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273054
9	NC_016050	TTA	2	6	587	592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273054
10	NC_016050	CAG	2	6	767	772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350273054
11	NC_016050	TAA	2	6	776	781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273054
12	NC_016050	AT	3	6	787	792	50 %	50 %	0 %	0 %	350273054
13	NC_016050	A	6	6	801	806	100 %	0 %	0 %	0 %	350273054
14	NC_016050	ATA	2	6	812	817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273054
15	NC_016050	ATT	2	6	833	838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016050	TTTA	2	8	866	873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016050	TGT	2	6	885	890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016050	AT	3	6	893	898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016050	ATA	2	6	1042	1047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273055
20	NC_016050	AAAGTA	2	12	1075	1086	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	350273055
21	NC_016050	TGA	2	6	1101	1106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273055
22	NC_016050	GTA	2	6	1139	1144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273055
23	NC_016050	CAA	2	6	1201	1206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	350273055
24	NC_016050	A	8	8	1205	1212	100 %	0 %	0 %	0 %	350273055
25	NC_016050	TAA	2	6	1230	1235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273055
26	NC_016050	ATTT	2	8	1247	1254	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016050	TCT	2	6	1350	1355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350273056
28	NC_016050	A	6	6	1358	1363	100 %	0 %	0 %	0 %	350273056
29	NC_016050	TC	3	6	1368	1373	0 %	50 %	0 %	50 %	350273056
30	NC_016050	A	6	6	1428	1433	100 %	0 %	0 %	0 %	350273056
31	NC_016050	AT	3	6	1493	1498	50 %	50 %	0 %	0 %	350273056
32	NC_016050	TA	3	6	1611	1616	50 %	50 %	0 %	0 %	350273056
33	NC_016050	ATA	3	9	1614	1622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273056
34	NC_016050	A	7	7	1640	1646	100 %	0 %	0 %	0 %	350273056
35	NC_016050	TGG	2	6	1678	1683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	350273056
36	NC_016050	TGA	2	6	1780	1785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273056
37	NC_016050	GAA	2	6	1837	1842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273056
38	NC_016050	AAT	2	6	1867	1872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273056
39	NC_016050	AAG	2	6	1884	1889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273056
40	NC_016050	TTA	2	6	1922	1927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273056
41	NC_016050	CAA	3	9	1985	1993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	350273056
42	NC_016050	T	8	8	2017	2024	0 %	100 %	0 %	0 %	350273057
43	NC_016050	A	6	6	2027	2032	100 %	0 %	0 %	0 %	350273057
44	NC_016050	T	6	6	2092	2097	0 %	100 %	0 %	0 %	350273057
45	NC_016050	T	7	7	2152	2158	0 %	100 %	0 %	0 %	350273057
46	NC_016050	T	6	6	2161	2166	0 %	100 %	0 %	0 %	350273057
47	NC_016050	GA	3	6	2179	2184	50 %	0 %	50 %	0 %	350273057
48	NC_016050	CGG	2	6	2206	2211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	350273057
49	NC_016050	AGC	2	6	2237	2242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350273057
50	NC_016050	ATA	2	6	2282	2287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273057
51	NC_016050	A	7	7	2287	2293	100 %	0 %	0 %	0 %	350273057
52	NC_016050	T	7	7	2311	2317	0 %	100 %	0 %	0 %	350273057
53	NC_016050	TA	3	6	2343	2348	50 %	50 %	0 %	0 %	350273057
54	NC_016050	TTTTA	2	10	2383	2392	20 %	80 %	0 %	0 %	350273057
55	NC_016050	ATA	2	6	2420	2425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273057
56	NC_016050	TAA	2	6	2451	2456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273057
57	NC_016050	TG	3	6	2459	2464	0 %	50 %	50 %	0 %	350273057
58	NC_016050	TTAT	2	8	2544	2551	25 %	75 %	0 %	0 %	350273057
59	NC_016050	AT	3	6	2603	2608	50 %	50 %	0 %	0 %	350273057
60	NC_016050	ATG	2	6	2681	2686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273057
61	NC_016050	TAT	2	6	2701	2706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273057
62	NC_016050	TTA	2	6	2715	2720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273057
63	NC_016050	ATTTA	2	10	2736	2745	40 %	60 %	0 %	0 %	350273057
64	NC_016050	TTAT	2	8	2766	2773	25 %	75 %	0 %	0 %	350273057
65	NC_016050	A	6	6	2830	2835	100 %	0 %	0 %	0 %	350273058
66	NC_016050	CTC	2	6	2912	2917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350273058
67	NC_016050	TC	3	6	2916	2921	0 %	50 %	0 %	50 %	350273058
68	NC_016050	ATT	2	6	2923	2928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273058
69	NC_016050	ATT	2	6	2936	2941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273058
70	NC_016050	T	6	6	2979	2984	0 %	100 %	0 %	0 %	350273058
71	NC_016050	ATT	2	6	3049	3054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273058
72	NC_016050	A	7	7	3093	3099	100 %	0 %	0 %	0 %	350273058
73	NC_016050	A	6	6	3110	3115	100 %	0 %	0 %	0 %	350273058
74	NC_016050	CAAA	2	8	3195	3202	75 %	0 %	0 %	25 %	350273058
75	NC_016050	AGA	2	6	3222	3227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273058
76	NC_016050	AGA	2	6	3237	3242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273058
77	NC_016050	AGC	2	6	3252	3257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350273058
78	NC_016050	TGC	2	6	3264	3269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350273058
79	NC_016050	TG	3	6	3284	3289	0 %	50 %	50 %	0 %	350273058
80	NC_016050	A	7	7	3364	3370	100 %	0 %	0 %	0 %	350273058
81	NC_016050	A	7	7	3383	3389	100 %	0 %	0 %	0 %	350273058
82	NC_016050	GA	3	6	3391	3396	50 %	0 %	50 %	0 %	350273058
83	NC_016050	T	6	6	3420	3425	0 %	100 %	0 %	0 %	350273058
84	NC_016050	ATT	2	6	3455	3460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273058
85	NC_016050	TATT	2	8	3462	3469	25 %	75 %	0 %	0 %	350273058
86	NC_016050	TCGC	2	8	3523	3530	0 %	25 %	25 %	50 %	350273058
87	NC_016050	A	6	6	3566	3571	100 %	0 %	0 %	0 %	350273058
88	NC_016050	TAT	2	6	3624	3629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273058
89	NC_016050	GCA	2	6	3652	3657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350273058
90	NC_016050	AGA	2	6	3750	3755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273058
91	NC_016050	AT	3	6	3784	3789	50 %	50 %	0 %	0 %	350273058
92	NC_016050	CTA	2	6	3845	3850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273058
93	NC_016050	TAT	2	6	3901	3906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273058
94	NC_016050	TTA	2	6	3907	3912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273058
95	NC_016050	GGTCA	2	10	3914	3923	20 %	20 %	40 %	20 %	350273058
96	NC_016050	TGT	2	6	3927	3932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350273058
97	NC_016050	AT	3	6	4094	4099	50 %	50 %	0 %	0 %	350273058
98	NC_016050	AG	3	6	4113	4118	50 %	0 %	50 %	0 %	350273058
99	NC_016050	ATA	2	6	4121	4126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273058
100	NC_016050	TA	3	6	4201	4206	50 %	50 %	0 %	0 %	350273058
101	NC_016050	GGC	2	6	4372	4377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	350273058
102	NC_016050	GCA	2	6	4396	4401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350273058
103	NC_016050	A	6	6	4423	4428	100 %	0 %	0 %	0 %	350273058
104	NC_016050	TA	3	6	4453	4458	50 %	50 %	0 %	0 %	350273058
105	NC_016050	GGA	2	6	4473	4478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350273058
106	NC_016050	GAA	2	6	4495	4500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273058
107	NC_016050	AAG	2	6	4526	4531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273058
108	NC_016050	AAT	2	6	4537	4542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273058
109	NC_016050	GAA	2	6	4543	4548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273058
110	NC_016050	TAA	2	6	4563	4568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273058
111	NC_016050	CTA	2	6	4587	4592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273058
112	NC_016050	TAAAT	2	10	4623	4632	60 %	40 %	0 %	0 %	350273058
113	NC_016050	AT	3	6	4645	4650	50 %	50 %	0 %	0 %	350273058
114	NC_016050	AAAACC	2	12	4849	4860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	350273058
115	NC_016050	AGT	2	6	4948	4953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273058
116	NC_016050	AAG	2	6	4979	4984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273058
117	NC_016050	ATA	2	6	5015	5020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273058
118	NC_016050	ATT	2	6	5066	5071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273058
119	NC_016050	TAA	2	6	5088	5093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273058
120	NC_016050	AATA	2	8	5094	5101	75 %	25 %	0 %	0 %	350273058
121	NC_016050	GAT	2	6	5107	5112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273058
122	NC_016050	ATTC	2	8	5131	5138	25 %	50 %	0 %	25 %	350273058
123	NC_016050	TGC	2	6	5145	5150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350273058
124	NC_016050	T	6	6	5173	5178	0 %	100 %	0 %	0 %	350273058
125	NC_016050	ATT	2	6	5189	5194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273058
126	NC_016050	TGC	2	6	5202	5207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350273058
127	NC_016050	CTA	2	6	5297	5302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273058
128	NC_016050	AGT	2	6	5334	5339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273058
129	NC_016050	CGC	2	6	5360	5365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	350273058
130	NC_016050	A	7	7	5383	5389	100 %	0 %	0 %	0 %	350273058
131	NC_016050	TTG	2	6	5396	5401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350273058
132	NC_016050	TTA	2	6	5425	5430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273058
133	NC_016050	ATA	2	6	5447	5452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273058
134	NC_016050	TAA	2	6	5516	5521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273058
135	NC_016050	ATA	2	6	5539	5544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273058
136	NC_016050	GAA	2	6	5545	5550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273058
137	NC_016050	A	6	6	5562	5567	100 %	0 %	0 %	0 %	350273058
138	NC_016050	ATA	2	6	5593	5598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273058
139	NC_016050	ATG	2	6	5626	5631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273058
140	NC_016050	AT	3	6	5679	5684	50 %	50 %	0 %	0 %	350273058
141	NC_016050	CAAAAT	2	12	5701	5712	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	350273058
142	NC_016050	A	6	6	5771	5776	100 %	0 %	0 %	0 %	350273058
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157	NC_016050	CTT	2	6	6212	6217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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160	NC_016050	T	6	6	6281	6286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_016050	TTAT	2	8	6318	6325	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_016050	TCC	2	6	6367	6372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
163	NC_016050	TAAA	2	8	6416	6423	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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243	NC_016050	AGT	2	6	9897	9902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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269	NC_016050	T	7	7	10906	10912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
270	NC_016050	TTA	2	6	10928	10933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
271	NC_016050	TAA	2	6	10968	10973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_016050	ATTT	2	8	10978	10985	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_016050	A	6	6	10991	10996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_016050	CAT	2	6	11004	11009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
275	NC_016050	TAC	2	6	11015	11020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
276	NC_016050	ATTA	2	8	11023	11030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NC_016050	ATC	2	6	11091	11096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
278	NC_016050	ATT	2	6	11116	11121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
279	NC_016050	TAT	2	6	11132	11137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_016050	ATTA	2	8	11235	11242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_016050	A	6	6	11247	11252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_016050	TGG	2	6	11291	11296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
283	NC_016050	GAATT	2	10	11323	11332	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
284	NC_016050	AGA	2	6	11392	11397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
285	NC_016050	GAT	2	6	11403	11408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
286	NC_016050	CCA	2	6	11414	11419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
287	NC_016050	T	6	6	11435	11440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_016050	CAT	2	6	11460	11465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_016050	TTA	2	6	11499	11504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_016050	ATA	2	6	11574	11579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_016050	A	6	6	11616	11621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_016050	T	6	6	11655	11660	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_016050	AT	3	6	11661	11666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_016050	AAT	2	6	11686	11691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_016050	ATT	2	6	11700	11705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
296	NC_016050	TTA	2	6	11711	11716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
297	NC_016050	TAT	3	9	11729	11737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
298	NC_016050	T	6	6	11784	11789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
299	NC_016050	A	6	6	11817	11822	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
300	NC_016050	A	6	6	11842	11847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
301	NC_016050	TTTA	2	8	11850	11857	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
302	NC_016050	T	6	6	11872	11877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
303	NC_016050	TGT	2	6	11887	11892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
304	NC_016050	AAT	2	6	11902	11907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
305	NC_016050	TAT	3	9	11963	11971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
306	NC_016050	AAT	2	6	11979	11984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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312	NC_016050	AAAT	2	8	12298	12305	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
313	NC_016050	T	6	6	12311	12316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
314	NC_016050	AATT	2	8	12325	12332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
315	NC_016050	CTT	2	6	12339	12344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
316	NC_016050	T	6	6	12343	12348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
317	NC_016050	TG	3	6	12361	12366	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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322	NC_016050	TTA	2	6	12492	12497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
323	NC_016050	TTAA	2	8	12506	12513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
324	NC_016050	TGG	2	6	12589	12594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
325	NC_016050	TA	3	6	12669	12674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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362	NC_016050	TAA	2	6	14432	14437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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417	NC_016050	ATA	2	6	16370	16375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273065
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421	NC_016050	T	8	8	16683	16690	0 %	100 %	0 %	0 %	350273066
422	NC_016050	TAA	2	6	16740	16745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273066
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462	NC_016050	A	7	7	18259	18265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
463	NC_016050	TTA	2	6	18269	18274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
464	NC_016050	TTA	2	6	18279	18284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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474	NC_016050	A	6	6	18831	18836	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
475	NC_016050	AGTA	2	8	18875	18882	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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